El 25 de mayo de 2010, el entonces fiscal general Guillermo Mendoza Diago ordenó que una investigación contra Emilio Tapia por corrupción al sufragante, que se llevaba en Montería, fuera designada a un fiscal delegado ante la Corte Suprema. La investigación se deriva de posibles actuaciones ilícitas de Tapia en épocas de elecciones para favorecer a políticos que aspiraron al Senado. Sin embargo, nada se ha vuelto a saber de ese expediente. Tapia enfrenta varios procesos por las irregularidades por el “Carrusel de la Contratación” en Bogotá y busca un preacuerdo con la Fiscalía para colaborar en otros procesos a cambio de pocos días de cárcel.
